O Mecanon possui intensas atividades de cooperação com universidades e institutos de pesquisas, nacionais e internacionais. Como integrante do INCT – Estruturas Inteligentes, o Mecanon participou de uma rede internacional que alavancou as pesquisas em materiais e estruturas inteligentes no Brasil.
Uma outra iniciativa pioneira é a TEES Brasil. A UFRJ possui uma sólida cooperação acadêmica com a Texas A&M University. Neste contexto, a COPPE e o College of Engineering se aproximaram identificando interesses em comum. Foi aí que surgiu a iniciativa TEES Brasil, conectando a COPPETEC com a TEES (Texas A&M Engineering Experiment Station) o que permite construir equipes sofisticadas compostas por pesquisadores das duas Instituições para desenvolver pesquisa e desenvolvimento.